Statistique épidémiologie

Cet ouvrage se propose de rendre attractives et compréhensibles les disciplines de la statistique et de l'épidémiologie pour les étudiants en sciences de la santé, mais aussi pour tous les professionnels de santé (médecins, pharmaciens, biologistes, infirmières, professions paramédicales, techniciens biologistes, vétérinaires).

Il met l'accent sur la compréhension des principes fondamentaux grâce auxquels il devient possible, à partir de nombreux exemples et exercices, d'utiliser les tests statistiques les plus appropriés pour une recherche ou pour la conduite d'une enquête épidémiologique.

La première partie étudie les outils servant à décrire les données. La deuxième aborde les méthodes d'estimation d'un paramètre inconnu à partir d'un échantillon. La troisième concerne l'emploi des tests statistiques. Elle comporte de nombreux tableaux pratiques d'aide au choix d'un test en fonction de la nature des problèmes, des paramètres à comparer et des conditions d'application ; cette partie est complétée par une série de « fiches pratiques » des principaux tests usuels. La quatrième partie est orientée vers les concepts statistiques utilisés en épidémiologie de terrain.

Afin de simplifier les calculs lors des exercices, cette seconde édition a été enrichie de renvois aux fonctions statistiques de quelques logiciels d'usage courant.

Cet ouvrage a pour ambition de fournir au lecteur une aide pratique, et de lui communiquer l'envie d'approfondir les notions de statistiques et d'épidémiologie qu'il aura entrevues.

Table des matieres

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PREMIERE PARTIE DEUXIEME PARTIE STATISTIQUE DESCRIPTIVE ESTIMATION

Chapitre 1 Chapitre 7
VARIABLES SONDAGE


I. Variables quantitatives . 3 I. Biais de selection 59

II. Variables qualitatives .. 5 II. Tirage au sort : Ie hasard .............. 60


III. Sondages aleatoires 60 Chapitre 2

IV. Sondages empiriques 65

ORGANISATION DES DONNEES
Chapitre 8


I. Tri des donnees . 9 MESURES STATISTIQUES

II. Regroupement en classes . 9 SUR UN ECHANTILLON

III. Transformation de variable . 10

IV. Effectifs et frequences .. . . 13

I. Parametres de posit ion . . . . . . ...... 69

V. Distribution . 13

II. Parametres de dispersion . ... . . . . . . 70

Chapitre 3

Chapitre 9
DESCRIPTION DES DONNEES


ESTIMATION D'UN PARAMETRE

I. Tableaux . 15

I. Estimation d'une moyenne inconnue .... 72

II. Graphiques .. 18

II. Estimation d'un pourcentage inconnu ... 74

III. Risque d'erreur consentie « .. --......... , 76


Chapitre 4

IV. Taille d'un echantillon ............ .. ....... 77


MESURES EN STATISTIQUE

I. Parametres de position . 23 TROISIEME PARTIE

II. Parametres de dispersion . 29 TESTS STATISTIQUES

Chapitre 5 Chapitre 10

REPRESENTATION D'UNE DISTRIBUTION
PRINCIPE DES TESTS


I. Variable discrete : frequences relatives des classes . . . 38 I. Principe des tests de comparaison 87

II. Variablecontinue:densitedeprobabillte 38 II. Principedestestsdeliaison ............... 93


III. Casd'une variable qual itative binaire 40

Chapitre 11 Chapitre 6 TESTS DE COMPARAISON LOIS DE DISTRIBUTION

I. TestZoutestdel'ecartreduit ........... 97


I. Loibinomiale .. 41 II. TestTdeStudent ...................... 101


II. Loi de Poisson . 46 III. Test F de Fisher-Snedecor 102

III. Loi normale .. 50 IV. Tests de l .................... 105




TABLE DES MATIERES

V. Test exact de Fisher 110 IV. Correlation lineaire mu ltiple . 170

VI. Tests non-pararnetrlques ou tests de rangs 112 V. Regression lineaire multiple . 170

VI. Test de Kolmogorov-Smirnov . 170

Chapitre 12

TESTS DE LIAISON

I. Test du X' d'ind ependa nce II. Test du X' de tendance 115 116 QUATRIEME PARTIE EPIDEMIOLOGIE

III. Test de corre lation IV. Regression .. . .. .. .. .. .. .. .. .. .. .. . 117 119 Chapitre 15 MESURES EN EPIDEMIOLOGIE



Chapitre 13

I. Mesures de base . 175 UTILISATION PRATIQUE DES TESTS STATISTIQUES II. Indicateurs epldemioloqiques 177

I. Criteres de choix d'un test statistique 123



Chapitre 16

II. Strateqie d'utilisation destests



ENQUETES EPIDEMIOLOGIQUES

statistiques ................... 124


III. Test Z pour compa rer une moyenne

I. Protoco le d'enquete .. 187 observee a une moyenne theorlque .. . 128

II. Types d'enquetes ... 190

IV. Test Z pour comparer deux moyennes . . 130

III. Enquet es de cohorte 192

V. TestZ pour comparer deux moyennes

IV. Enquetes cas-temoins 196 sur deux series appariees 132

V. Enquetes transversales 201

VI. TestT pour comparer une moyenne

VI. Criteres de causalite dans une enquete observee a une moyenne theorique .... 134

etiologique . 202

VII. Test T de Student po ur comparer deux

VII. Biaisdans lesenquetes etioloqiques .. 202

moyennes 136 VIII. Prise en compte d'un tiers facteur:

VIII. Test T pour comparer 2 moyennes analyse stratiflee . 205

sur 2 series appa riees 138

IX. Test F pour compa rer deux var iances 140



Chapitre 17

X. Test F pour comparer plusieurs

INVESTIGATION D'UNE EPIDEMIE

moyennes ........... 142


XI. Testde Wilcoxon ... 144 I. Definitions 213

XII. TestdeWilcoxonpourseriesappariees . 146 II. Objectifs ................ 214


XIII. Test de Kruskall-Wall is 148

III. Chronologie 215

XIV. Testde l de conformlte ou d'ajustement 150 IV. Aspects operationnels ........... 223 Xv. Test de X' d'hornoqeneite 152

XVI. Test de X' a4 cases pour comparer Chapitre 18 deux pou rcentages . 154



MESURES D'IMPACT

XVII. Test de X' de McNemar pour series

I. Fraction etioloqique du risque 225

appa riees . . 156 XVIII.Test de X' d'independance . 158

II. Fraction preventive ................... 227


III. Intervalle de confiance .. . 228XIX. Test de X' de tendance . 160

XX. Test du coefficient de correlation 162



Chapitre 19

XXI. Test du coefficient de correlation des rangs de Spearman . 164 STANDARDISATION DES TAUX

I. Position du problema 231

Chapitre 14

II. Principe 231



TESTS STATISTIQUES DIVERS

III. Methode directe .. 232

I. Epreuve de norma lit e . 167 IV. Methode indirecte 233

II. Testde Bartlett .. 170 V. Conditions d'application 234

III. Testde Levene .. 170 VI. Extension de la methode ................ 234


Chapitre 20 ANNEXES ANALYSE DE SURVIE

Reponses aux questions des exercices 257


I.

Principe ............................. 235 Rappels rnathernatlques 267


II.

Methode de Kaplan-Meier 236 Formulaire statistique 271


III.

La methode aetuarielle 238


IV.

Comparaison de courbes de survie :
test du log rank ,,,............... 238


Bibliographie 281


Chapitre 21


PERFORMANCES D'UNE TECHNIQUE Glossaire 283


I.

Mesure experirnentale
desperformances d'untest 241 Tablesstatistiques 291


II.

Performances d'un test en situation reelle 247


III.

Reproductibll ite et concordance 250 Index 297