Cours de génétique des populations

Sommaire et contenu du livre "Cours de génétique des populations"

SOMMAIRE Introduction générale 9 1. Les populations biologiques 11 1.1. La reconnaissance spécifique Il 1.1.1. L'espèce biologique 11 1.1.2. Reproduction asexuée et sexuée 12 1.1.3. Les variations de la contribution reproductrice 12 1.2. Les variations biogéographiques 12 1.2.1. La répartition historique et les variations temporelles 13 1.2.2. La distribution des dines 14 1.2.3. La structure populationnelle de l'espèce 17 1.3. La constitution génétique des populations 18 1.3.1. L'hypothèse de la panmixie 18 1.3.2. Le modèle de Hardy-Weinberg 19 1.3.3. Test d'équilibre 20 2. Les gènes dans les populations 22 2.1. Fréquence à deux allèles 22 2.1.1. La codominance des allèles autosomiques 22 2.1.2. La dominance totale 24 2.1.3. Les caractères influencés par le sexe 25 2.2. Fréquence à allèles multiples 26 2.2.1. Généralisation pour k allèles 26 2.2.2. La codominance liée au sexe 28 2.2.3. Les caractères quantitatifs ou quasi quantitatifs 29 2.3. La fréquence des hétérozygotes 31 2.3.1. Le taux moyen d'hétérozygotie 31 2.3.2. L'homogamie et le coefficient de consanguinité 33 2.3.3. Le coefficient de parenté et les systèmes haplo-diploïdes 35 3. La variation des gènes 38 3.1. La variabilité génétique 38 3.1.1. Les polymorphismes morphologiques et biochimiques 38 3.1.2. Les taux d'héritabilité 41 3.1.3. L'amélioration des races .42 3.2. Les apports exogènes d'allèles nouveaux .44 3.2.1. Les migrations et l'effet fondateur. 44 3.2.2. Les flux migratoires: le modèle de l'archipel... .45 3.2.3. L'organisation populationnelle et l'effet Wahlund .47 3.2.4. L'hybridation et l'introgression 49 3.3. Les apports endogènes d'allèles nouveaux 50 3.3.1. Les mutations géniques 50 3.3.2. Les taux de mutation 51 3.3.3. L'effet des mutations 52 4. La variation des combinaisons et la divergence des populations 55 4.1. Le chromosome comme unité 55 4.1.1. La recombinaison et la redistribution des allèles 55 4.1.2. Les remaniements chromosomiques et la fusion roberrsonienne 56 4.1.3. Le changement du nombre de chromosomes 59 4.2. Les distances génétiques 60 4.2.1. La distance relative et la recombinaison 60 4.2.2. L'équilibre de liaison 61 4.2.3. La variance épistatique et l'auto-stop génétique 61 4.3. La divergence des populations 62 4.3.1. La différenciation génétique 62 4.3.2. Les niveaux de structuration 63 4.3.3. La diversification des populations 64 5. L'origine du polymorphisme dans les populations naturelles 67 5.1. La dérive génétique 67 5.1.1. La dérive aléatoire des fréquences 67 5.1.2. L'indice de fixation et l'effet goulet d'étranglement 69 5.1.3. L'effectif efficace et les paramètres de dispersion 71 5.2. L'explication neutraliste: le polymorphisme aléatoire 73 5.2.1. Les principes de la théorie des mutations neutres 74 5.2.2. La régularité des taux de substitution 74 5.2.3. Les objections 75 5.3. L'explication sélective: le polymorphisme adaptatif... 76 5.3.1. La signification de l'adaptation 76 5.3.2. La valeur adaptative 80 5.3.3. Le coefficient de sélection 81 6. Les paysages adaptatifs 82 6.1. La sélection naturelle et les valeurs adaptatives 82 6.1.1. Le théorème de la sélection naturelle de Fisher 82 6.1.2. Les modalités de la sélection et les interactions entre gènes 85 6.1.3. L'effet d'hétérosis et le fardeau génétique 87 6.2. Les pressions sélectives 91 6.2.1. Les pressions combinées 91 6.2.2. Sélection disruptive ou stabilisante 93 6.2.3. La sélection interdémique et la théorie des équilibres mobiles 93 6.3. La transformation génétique des populations 95 6.3.1. La spéciation divergente ou oscillatoire 95 6.3.2. La parenté et le problème du DNA extra nucléaire 96 6.3.3. Les horloges moléculaires et les arbres phylogénétiques 96 6.4. L'origine des populations humaines 97 6.4.1. A la source du lait 97 6.4.2. La divergence des populations humaines 98 Conclusion générale 99 Annexe 1 : Les techniques d'étude en génétique des populations 101 1. Les plans de croisement..... 101 2. L'électrophorèse des protéines 102 3. Les méthodes d'étude du DNA 104 4. Les perspectives 106 Annexe 2 : Le polymorphisme de Cepaea nemoralis 107 1. Le déterminisme du polychromatisme 107 2. La répartition des phénotypes 108 3. Les explications du polymorphisme 109 Annexe 3 : Interprétation génétique des zymogrammes et construction d'un arbre phylétique 110 1. L'analyse des caractères 110 2. Interprétation du zymogramme III 3. Elaboration d'un dendogramme 113 Bibliographie 115 Index 123