Gestion des habitats naturels et biodiversité
Concepts, méthodes et démarches

Sommaire et contenu du livre "Gestion des habitats naturels et biodiversité - Concepts, méthodes et démarches"

Table des matières Avant-propos V Sigles et abréviations IX Introduction 1 Première partie Identification des habitats : le recours aux démarches de la phytosociologie Chapitre 1 Principes généraux de la phytosociologie 1. Naissance et développement de la phytosociologie 7 1.1. De la géobotanique à la notion d'association végétale 7 1.2. Développement de la phytosociologie en Europe 9 1.3. Orientation américaine 10 1.4. Développement de l'écologie 11 1.5. Histoire récente 12 2. Démarches de la phytosociologie 16 2.1. Démarches de classification de la végétation ' 16 2.1.1. Analogie entre systématique et phytosociologie 17 2.1.2. Fondement statistique 18 2.1.3. Méthodologie 18 2.1.4. Systèmes de classification CEPS et AAPE 20 2.2. Démarche typologique 23 2.3. Démarche conservatoire 24 2.3.1. Constat de la variabilité 25 2.3.2. Recours à l'écologie des communautés 26 2.3.3. Définir précisément les objets d'étude 27 2.3.4. Recours à des expérimentations 27 2.3.5. Les variations floristiques et structurales en tant qu'indicateurs 28 Chapitre 2 Phases analytiques de terrain 1. Plan d'échantillonnage 31 1.1. Remarques préliminaires 31 1.2. Méthodes 35 1.2.1. Analyse linéaire 36 1.2.2. Analyse spatiale 37 1.3. Quelques exemples de délimitation d'individus d'association 43 2. Relevé phytosociologique 45 2.1. Description générale de l'individu d'association 45 2.2. Codification du relevé 45 2.3. Inventaire des espèces 46 2.4. Quantification du relevé 50 2.4.1. Indice d'abondance-dominance de Braun-Blanquet 50 2.4.2. Indice de sociabilité 52 2.5. Analyse écologique 52 Chapitre 3 Méthodes de classification 1. Tableau brut des relevés 57 2. Recherche des assemblages d'espèces 59 2.1. Méthode des tableaux 60 2.2. Méthodes par analyses numériques 60 3. Catégories d'espèces 68 4. Vérification de la cohérence des partitions 71 5. Synthèse des informations concernant une association végétale 73 Chapitre 4 Établissement de systèmes typologiques 1. Principes d'élaboration du synsystème 75 2. Nomenclature des unités phytosociologiques 77 3. Statut des syntaxons 80 4. Applications à Natura 2000 81 4.1. Identification des habitats 81 4.2. Cartographie des habitats 82 Chapitre 5 Approche paysagère 1. Principes généraux , 85 1.1. Symphytosociologie (ou phytosociologie sériale) 85 1.2. Géosymphytosociologie (ou phytosociologie caténale) 86 2. Pratique 86 3. Utilité 88 3.1. Établissement de typologies paysagères 89 3.2. Description des mosaïques de végétation 91 Conclusion 93 Deuxième partie Interprétation écologique des habitats : le recours à l'écologie des communautés Chapitre 6 Considérations générales 1. Définitions et démarches 99 2. Rappels sur le concept d'écosystème 104 3. Fonctions des végétaux dans les systèmes écologiques 105 Chapitre 7 Théories et concepts liés à la dynamique de la biodiversité 1. La biodiversité : une longue histoire 109 2. Théories et concepts relatifs aux interactions écologiques III 2.1. Concept de niche écologique ' 111 2.2. Principe d'exclusion compétitive et théorie de la différenciation de niches 114 2.3. Des théories de J'équilibre aux théories du non-équilibre 115 2.3.1. Théories de J'équilibre ' 115 2.3.2. Théories du non-équilibre 118 3. La dynamique de la biodiversité ou le jeu incessant et aléatoire des interactions 121 3.1. Successions végétales 121 3.2. Dynamique de la végétation et régimes de perturbation 125 3.3. Des processus évolutifs sous nos yeux 126 3.4. Une organisation spatiale « en mouvement» 126 3.5. Des états de biodiversité tributaires des perturbations et du paysage 127 3.5.1. Théorie de la perturbation intermédiaire 127 3.5.2. Théorie de la biogéographie insulaire ou des équilibres dynamiques 129 3.6. Modèles synthétiques d'assemblage des espèces au niveau des communautés 130 Chapitre 8 Stratégies adaptatives et groupes fonctionnels 1. Concept de stratégie adaptative 135 1.1. Une démarche en fait ancienne 135 1.2. Concept de stratégie adaptative 137 1.2.1. Système CSR de Grime (1977) 138 1.2.2. Autres systèmes 140 2. Groupes fonctionnels et types fonctionnels de plantes (TFP) 141 2.1. Démarches de classification 142 2.2. Démarche explicative et prédictive 149 2.3. Démarche fonctionnelle 155 Chapitre 9 Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes 1. Hypothèses générales concernant le rôle des espèces dans le fonctionnement des écosystèmes 157 2. Biodiversité et fonctionnement des écosystèmes 159 2.1. Biodiversité et stabilité des écosystèmes 159 2.2. Biodiversité et productivité 160 2.3. Biodiversité et cycles biogéochimiques 160 Chapitre 10 Exemples de démarches interprétatives 1. Description du modèle écologique 164 2. Résultats attendus 166 3. Protocole expérimental 168 4. Résultats obtenus 170 5. Interprétation 171 6. Compléments d'informations 173 6.1. Une organisation en mosaïque des unités de végétation 173 6.2. Dynamique spatiale et temporelle de la mosaïque d'habitats 177 6.3. Hétérogénéité fonctionnelle de la mosaïque d'habitats 178 6.4. Stabilité fonctionnelle et diversité spécifique 183 Conclusion 185 Troisième partie Gestion des habitats : le recours à l'écologie de la conservation et de la restauration Chapitre Il Raisonnement général 1. Nécessité de définir des références pour évaluer 193 2. Nécessité d'une approche spatialisée ou paysagère 196 3. Nécessité de considérer les fonctionnalités des habitats 197 4. Nécessité de démarches intégratives 197 Chapitre 12 Définition d'états et/ou de systèmes de références et/ou d'objectifs 1. Un objectif scientifique à atteindre: la modélisation des systèmes écologiques 202 2. Quelles questions pour guider la démarche? , 203 3. Quelles variables pour la structuration du compartiment « végétation» ? 209 4. Comment appréhender les variables de structuration? 213 4.1. Mesures directes 213 4.2. Mesures indirectes 213 5. Quels états et/ou systèmes de références et/ou objectifs? 216 5.1. Au niveau de l'habitat élémentaire 216 5.2. Au niveau des complexes d'habitats 217 6. Recours à des expérimentations pour mieux cerner les références 218 6.1. Caractéristiques abiotiques des habitats 219 6.2. Compositions foristiques, trajectoires successionnelles et indicateurs 220 6.3. Capacités de réversibilité des stades successionnels 224 7. Intégrer d'autres composantes du système écologique 226 Chapitre 13 Diagnostic via la mise en œuvre de méthodologies appropriées 1. Rappels sur la démarche 229 2. Quels indicateurs? 231 3. Quels protocoles? 231 3.1. Quels protocoles pour des diagnostics d'état des habitats? 231 3.1.1. Au niveau des habitats élémentaires 231 3.1.2. Au niveau des complexes d'habitats 233 3.2. Quels protocoles pour des diagnostics concernant les processus? 234 4. Diagnostic 236 Chapitre 14 Démarches de mise en œuvre de gestion de conservation et de restauration 1. Démarche générale 239 2. Prise en compte des concepts de l'écologie de la restauration 240 3. Recours à une approche spatialisée 245 Conclusion 247 Conclusion générale 249 Annexe 1 Méthodes d'analyses numériques 1. Quelques principes généraux 259 1.1. À quoi peuvent répondre les analyses numériques? 259 1.2. Quelles sont les méthodes d'analyses numériques qui peuvent être utilisées? .. 260 1.3. Quelques rappels sur la recherche de relations entre variables et entre relevés .. 260 2. Méthodes d'analyses multivariées 263 2.1. Méthodes de classification 263 2.2. Méthodes d'ordination 264 2.2.1. Analyse en composantes principales CAep) 264 2.2.2. Autres méthodes 270 Conclusion 271 Annexe 2 Traitement des relevés phytosociologiques par le logiciel Ginkgo 1. Étapes préparatoires 273 1.1. Préparation du fichier Excel 275 1.2. Importation du tableau de relevés 276 1.3. Préparation des matrices pour l'analyse des données 277 2. Analyses numériques des données 277 2.1. Classification des relevés 277 2.2. Ordination des relevés 280 3. Analyses complémentaires 285 3.1. Analyses des données par ACP 285 3.2. Analyses des données par ACC 290 Annexe 3 Traitement des relevés phytosociologiques par le logiciel Juice 1. Étapes préparatoires 295 1.1. Préparation du fichier Excel 295 1.2. Importation du tableau de relevés 296 2. Analyses des données 299 2.1. Classification des relevés 299 2.2. Tableau analytique et tableau synthétique 301 2.2.1. Réorganisation du tableau analytique 301 2.2.2. Réalisation d'un tableau synthétique (ou tableau synoptique) 302 3. Analyses complémentaires 305 3.1. Caractérisation des relevés du point de vue de la diversité spécifique 305 3.2. Caractérisation des relevés du point de vue écologique 305 Annexe 4 Identification des habitats 1. Documentation disponible pour l'identification des habitats 307 2. Adresses internet permettant d'accéder aux bases d'informations 308 Annexe 5 Gestion conservatoire des habitats 1. Établissement d'une documentation de référence 313 2. Établissement d'un diagnostic d'état de la conservation et conception de modalités de gestion 314 Références bibliographiques 317 Index 327